Transmissions d’entérobactéries productrices de carbapénèmases lors de cholangiopancréatographies rétrogrades endoscopiques : limite des prélèvements microbiologiques environnementaux et contribution du séquençage de nouvelle génération / Mélanie Mercier-Darty in Hygiènes, vol.27 n°3 (juin 2019)

ISBD Public [article] Transmissions d’entérobactéries productrices de carbapénèmases lors de cholangiopancréatographies rétrogrades endoscopiques : limite des prélèvements microbiologiques environnementaux et contribution du séquençage de nouvelle génération [revue] / Mélanie Mercier-Darty, Auteur ; Florence Cizeau, Auteur ; David Ducellier, Auteur . - 2019 . - p.139-144. Langues : Français in Hygiènes > vol.27 n°3 (juin 2019) . - p.139-144 Mots-clés : désinfection dispositif médical EPC entérobactérie productrice de carbapénèmase génome IAS infection associée aux soins microbiologie séquençage Résumé : Nous rapportons une épidémie de contamination par une entérobactérie productrice de carbapénèmase (EPC) mise en évidence par la comparaison par séquençage complet des génomes des souches impliquées. Méthode. Nous avons investigué la découverte d’une bactériémie à Klebsiella pneumoniae OXA-48 chez une patiente sans facteur de risque. L’enquête a mis en évidence six cas ayant en commun l’utilisation d’un même duodénoscope pour une cholangiopancréatographie rétrograde endoscopique (CPRE). L’endoscope a été prélevé, expertisé à deux reprises puis séquestré et les souches comparées par séquençage de leur génome et utilisation d’une approche par core genome multilocus sequence typing (cgMLST). Des audits de pratiques ont été réalisés. Résultats. Les souches de K. pneumoniae étaient considérées comme reliées chez cinq patients ; le sixième était porteur d’une souche d’Escherichia coli dont le support plasmidique de la résistance était semblable à celui retrouvé chez K. pneumoniae. Les pratiques étaient conformes. Les prélèvements microbiologiques et les expertises n’ont pas permis d’identifier de non-conformité. L’analyse épidémiologique et les données de comparaison des souches ont été jugées suffisamment pertinentes pour retirer définitivement l’endoscope incriminé. Conclusions. La technique de prélèvement des duodénoscopes pour CPRE gagnerait à être améliorée conformément aux recommandations récentes. La comparaison de souches par séquençage complet est un outil utile et objectif pour prouver une transmission croisée. [article]  in Hygiènes > vol.27 n°3 (juin 2019) . - p.139-144 Titre : Transmissions d’entérobactéries productrices de carbapénèmases lors de cholangiopancréatographies rétrogrades endoscopiques : limite des prélèvements microbiologiques environnementaux et contribution du séquençage de nouvelle génération Type de document : revue Auteurs : Mélanie Mercier-Darty, Auteur ; Florence Cizeau, Auteur ; David Ducellier, Auteur Année de publication : 2019 Article en page(s) : p.139-144 Langues : Français Mots-clés : désinfection dispositif médical EPC entérobactérie productrice de carbapénèmase génome IAS infection associée aux soins microbiologie séquençage Résumé : Nous rapportons une épidémie de contamination par une entérobactérie productrice de carbapénèmase (EPC) mise en évidence par la comparaison par séquençage complet des génomes des souches impliquées. Méthode. Nous avons investigué la découverte d’une bactériémie à Klebsiella pneumoniae OXA-48 chez une patiente sans facteur de risque. L’enquête a mis en évidence six cas ayant en commun l’utilisation d’un même duodénoscope pour une cholangiopancréatographie rétrograde endoscopique (CPRE). L’endoscope a été prélevé, expertisé à deux reprises puis séquestré et les souches comparées par séquençage de leur génome et utilisation d’une approche par core genome multilocus sequence typing (cgMLST). Des audits de pratiques ont été réalisés. Résultats. Les souches de K. pneumoniae étaient considérées comme reliées chez cinq patients ; le sixième était porteur d’une souche d’Escherichia coli dont le support plasmidique de la résistance était semblable à celui retrouvé chez K. pneumoniae. Les pratiques étaient conformes. Les prélèvements microbiologiques et les expertises n’ont pas permis d’identifier de non-conformité. L’analyse épidémiologique et les données de comparaison des souches ont été jugées suffisamment pertinentes pour retirer définitivement l’endoscope incriminé. Conclusions. La technique de prélèvement des duodénoscopes pour CPRE gagnerait à être améliorée conformément aux recommandations récentes. La comparaison de souches par séquençage complet est un outil utile et objectif pour prouver une transmission croisée.

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